目前采用的消毒技术主要有：液氯、 臭氧、二氧化氯、紫外线。由于液氯消毒带来的二次污染、以及余氯对人体的刺激；而紫外线消毒有死角，现已被国家禁止使用。使得没有类似问题的其它消毒方法得到应用。其中，臭氧、二氧化氯是新兴的最为重要的消毒方法。各种消毒杀菌方法的效果和优缺点的比较如表所示。
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项目
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液氯
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二氧化氯
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紫外线
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臭氧
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需要处理时间
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10～30分钟
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比液氯稍快
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最小
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5～10分钟
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对细菌的有效性
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有
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有
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有
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有
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对病毒的有效性
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有一些
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有一些
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有一些
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有
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设备投资
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最低
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比液氯高，比其它方法低许多
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比臭氧高
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液氯的5倍
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运行费用
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最低
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比液氯高，比其他方法稍低
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与臭氧类似
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比液氯高
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优点
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1、价廉
2、技术成熟
3、有保护性余氯
4、有持续杀菌的能力
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1、价廉
2、可现场制造，技术成熟
3、有持续杀菌能力
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杀菌效应快
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1、除色臭味快
2、广谱杀菌消毒，消毒效率是氯消毒的15倍
3、无二次污染
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缺点
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1、对病毒无效
2、其氧化性对人体有害
3、有刺激性气味并损害人体皮肤
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1、对病毒无效
2、气态的二氧化氯是剧毒的化合物，对人体有害，且与液氯一样会有致癌的二次污染物的产生
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1、价格贵
2、无持续杀菌能力
3、对水的前处理要求高
4、穿透力弱
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1、价格贵
2、无持续杀菌能力
3、安全要求高
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适合类型
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所有类型的污水处理或给水处理
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1、所有类型的污水处理
2、所有类型的给水处理
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1、不适合污水处理
2、简单空气杀菌
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1、适合所有场合水处理的杀菌和消毒
2、空气消毒
3、器械表面消毒
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通过上表可以看出，在消毒杀菌的有效性方面，臭氧与紫外线差不多，但臭氧的应用范围要比紫外线广泛而彻底。在设备投资和运行费用方面，臭氧≈紫外线>二氧化氯>液氯。但根据对各种消毒方法的总体评价，臭氧是一种非常好杀菌消毒的方法。
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